Varianti SARS-CoV-2: quali sono? Omicron, Cerberus, Gryphon e Kraken

Varianti SARS-CoV-2: quali sono? Omicron, Cerberus, Gryphon e Kraken
Ultima modifica 18.01.2023
INDICE
  1. Introduzione
  2. Mutazioni e Varianti
  3. Varianti Coronavirus
  4. Varianti di Preoccupazione - VOC
  5. Sottovarianti Omicron sotto monitoraggio
  6. Varianti di Interesse - VOI
  7. Varianti sotto Monitoraggio - VUM
  8. Sintomi delle Varianti
  9. Farmaci e Vaccini
  10. Individuazione delle Varianti
  11. Monitoraggio delle Varianti
  12. Come Proteggersi dalle Varianti?
  13. Ulteriori approfondimenti

Le fonti consultate per la stesura di questo articolo sono i siti ufficiali del Ministero della Salute, dell'Istituto Superiore di Sanità (ISS), dell'Organizzazione Mondiale della Salute (OMS) e dell'ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control).

Introduzione

SARS-CoV-2 è il virus responsabile della malattia nota come COVID-19 e della pandemia che interessa ormai tutti i Paesi del Mondo.

Analogamente a qualsiasi altro virus, anche SARS-CoV-2 presenta una tendenza alla mutazione dando origine a varianti diverse, alcune di queste preoccupano più di altre. Vediamo quindi quali sono e cosa sappiamo sul loro conto. Prima di ciò, tuttavia, può essere utile fare un passo indietro e capire perché e cosa significa che il virus muta.

Per approfondire: Coronavirus: Cos'è? Sintomi e Contagio

Approfondimento: Varianti COVID o Varianti di SARS-CoV-2?

In molte occasioni si legge o si sente parlare di "varianti COVID"; tuttavia, è bene precisare che tale dicitura non è corretta. Questo perché è il virus - in questo caso SARS-CoV-2 o nuovo Coronavirus, che dir si voglia - a mutare, quindi a generare varianti man mano che si diffonde e si replica. La COVID (Coronavirus Disease), invece, è la malattia che l'infezione virale è in grado di scatenare e qualsiasi variante può causarla.

Pertanto, è più corretto parlare di "varianti di SARS-CoV-2", piuttosto di "varianti COVID", benché ormai si tratti di una diciutura entrata a far parte del linguaggio comune.

Mutazioni e Varianti

Cosa significa che il Virus Muta e Come si formano le Varianti di SARS-CoV-2?

Partiamo con il dire che nei virus la mutazione del genoma è un fenomeno da considerarsi normale, soprattutto per quelli ad RNA quale è il SARS-CoV-2.

Una variante di un virus si genera quando questo, moltiplicandosi all'interno delle cellule dell'ospite, subisce una o più modificazioni - definite, per l'appunto, mutazioni - all'interno del suo genoma (o patrimonio genetico), rendendolo in questo modo differente rispetto al virus originario.

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Mutazioni del nuovo Coronavirus sono state osservate fin dalle primissime fasi della pandemia. Tuttavia, mentre alcune di esse non hanno un impatto di diretto e significativo beneficio per il virus, altre possono conferirgli caratteristiche che ne possono migliorare la sopravvivenza, come, ad esempio, una maggiore trasmissibilità, una maggiore patogenicità con induzione di una forma di malattia più severa (COVID-19 nel caso specifico di SARS-CoV-2) o la possibilità di "aggirare" l'immunità acquista dall'individuo in seguito ad un'infezione naturale o ad eventuali vaccini. Nel momento in cui il virus si "arricchisce" di queste caratteristiche si ha che fare con varianti che generano preoccupazione.

Varianti Coronavirus

Quali sono le Varianti di SARS-CoV-2 che stanno preoccupando di più?

Le varianti del nuovo Coronavirus che suscitano le preoccupazioni maggiori sono caratterizzate da differenti mutazioni, fra cui mutazioni della proteina nota come "spike", ovvero quella proteina virale che consente allo stesso virus di "agganciarsi" alle cellule dell'organismo ospite.

Le varianti sono inserite all'interno di diversi gruppi in funzione delle loro caratteristiche e del grado di preoccupazione suscitato. A questo proposito, è possibile distinguere:

  • Varianti di preoccupazione;
  • Varianti di interesse;
  • Varianti sotto monitoraggio.

A questi gruppi, l'OMS ha deciso di aggiungerne un quarto denominato "Sottovarianti di Omicron sotto monitoraggio", a causa dell'aumento della prevalenza di questa variante e delle sue sottovarianti ormai a livello globale.

Nei capitoli che seguiranno entreremo più nel dettaglio.

Per approfondire: Varianti Coronavirus SARS-CoV-2: le Mutazioni del Virus

NOTA BENE

Nei capitoli successivi verranno riportate le varianti di preoccupazione, di interesse e sotto monitoraggio secondo la classificazione dell'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS o WHO - World Health Organization).

Tale classificazione potrebbe differire da quella del Centro europeo per la prevenzione e il controllo delle malattie (ECDC - European Centre for Disease Prevention and Control).

Varianti di Preoccupazione - VOC

Le varianti di preoccupazione o VOC (dall'inglese Variants of Concern) sono state inizialmente nominate in funzione del luogo in cui sono state isolate la prima volta; in seguito, l'OMS (Organizzazione Mondiale della Sanità), ha deciso di rinominare le varianti con lettere greche di modo da evitare l'insorgere di discriminazioni nei confronti dei Paesi nei quali le varianti sono state identificate inizialmente.

Ad ottobre 2022, la variante che suscita maggiore preoccupazione è la variante Omicron e, in particolare, le sue sottovarianti. Vediamole più nel dettaglio.

Variante Omicron o BA.1

La variante Omicron - anche nota come BA.1 - ha iniziato a destare preoccupazione a fine novembre 2021. I primi casi sono stati segnalati in Botswana e Sudafrica.

La variante Omicron presenta più di 30 mutazioni della proteina spike (ossia quella impiegata dal coronavirus per eludere le difese delle cellule del nostro organismo) e presenta quasi tutte le mutazioni delle varianti di preoccupazione (VOC).

Benché la presenza di mutazioni non significhi necessariamente che la variante in questione sia più rischiosa di quelle attualmente circolanti, omicron desta comunque preoccupazioni in quanto si teme possa essere più contagiosa e che possieda una capacità maggiore di eludere le difese immunitarie già sviluppate.

Per approfondire: Variante Omicron SARS-CoV-2: Sintomi, Contagiosità e Vaccini

Sottovariante Omicron 2 o BA.2

Anche la sottovariante di Omicron - chiamata comunemente Omicron 2 e indicata come BA.2 - rientra all'interno delle varianti di preoccupazione.

Tale sottovariante presenta modificazioni in alcune delle mutazioni di Omicron, incluse quelle nella proteina Spike. Sulla base dei dati finora disponibili, Omicron 2 appare più contagiosa di Omicron, ma - almeno pe ril momento - non sembra aumentare i casi di ospedalizzazione.

Per approfondire: Omicron 2: Cos’è una Sottovariante? Cosa Sapere su Omicron BA.2

Altre sottovarianti Omicron

Oltre ad Omicron 1 e 2, rientrano nella lista delle varianti di preoccupazione anche altri tipi di sottovarianti Omicron, quali:

  • Omicron 3 (o BA.3);
  • Omicron 4 (o BA4);
  • Omicron 5 (o BA.5);
  • Varianti Omicron ricombinanti BA.1/BA.2, come la variante XE (si tratta di una variante di SARS-CoV-2 derivante dalla ricombinazione fra le varianti Omicron BA.1 e Omicron 2 BA.2, segnalata per la prima volta nel Regno Unito, a gennaio 2022).
Per approfondire: Omicron 5 e contatto con caso COVID: dopo quanto si diventa positivi? Omicron: dopo quanto tempo ci si può reinfettare? Come proteggersi?

Focus su Omicron 5

Omicron 5 o BA.5 è diventata la sottovariante di Omicron prevalente nel nostro Paese, così come in molti altri nel Mondo nel iro di poco tempo.

Non sorprende quindi, come la ricerca in campo di vaccini si sia focalizzata nei confronti di Omicron e delle sue sottovarianti, portando alla realizzazione di vaccini bivalenti specifici il cui uso è già approvato in Europa e in Italia, quali:

  • Comirnaty Original/Omicron BA.1 (efficace contro il ceppo originario di SARS-CoV-2 e contro la variante Omicron 1);
  • Spikevax Bivalent Original/Omicron BA.1 (efficace contro il ceppo originario di SARS-CoV-2 e contro la variante Omicron 1);
  • Comirnaty Original/Omicron BA.4-5 (efficace contro il ceppo originario di SARS-CoV-2 e contro le sottovarianti Omicron BA.4 e BA.5).

Il 19 ottobre 2022, il Comitato per i medicinali per uso umano (CHMP) dell'EMA ha raccomandato l'autorizzazione del vaccino bivalente messo a punto da Moderna: Spikevax Bivalent Original/Omicron BA.4-5. Il parere verrà poi inviato alla Commissione Europea che adotterà una decisione finale.

Per informazioni più dettagliate, consulta l'articolo dedicato: Vaccini aggiornati Omicron: quali sono? Chi può farli e quando?

Sottovarianti Omicron sotto monitoraggio

In seguito alla veloce diffusione di Omicron e di tutte le sue sottovarianti a livello globale - tanto da diventare ormai la variante prevalente in tutto il Mondo - l'OMS ha aggiunto una nuova categoria al suo sistema di tracciamento delle varianti: la categoria "sottovarianti di Omicron sotto monitoraggio".

L'obiettivo dell'introduzione di questa nuova categoria è indagare se queste nuove sottovarianti - che in alcuni casi sono varianti di sottovarianti - possono rappresentare un'ulteriore minaccia per la salute pubblica globale rispetto ad altre forme già circolanti.

Le sottovarianti di Omicron sotto monitoraggio sono diverse.

Fra queste, una di quelle che probabilmente ha suscitato maggior clamore nell'estate 2022, è BA.2.75, soprannominata variante "Centaurus".

Individuata per la prima volta in India a maggio 2022, BA.2.75 si è poi diffusa in altri Paesi, quali Regno Unito, Stati Uniti, Germania, Giappone, Canada, Nepal, Indonesia, Nuova Zelanda.

BA.2.75 è considerata una variante della sottovariante Omicron 2 (BA.2), poiché si ritiene che derivi da essa. A renderla oggetto di osservazione e preoccupazione sono le numerose mutazioni presentate, non solo a livello della proteina Spike, ma anche in altri siti.

Oltre a Centaurus, rientrano in questo gruppo sotto monitoraggio anche le sottovarianti:

  • BF.7;
  • BQ.1 (nota anche come "variante Cerberus");
  • XBB (anche nota come "variante Gryphon") e suoi sottolignaggi, fra cui XBB.1.5 (soprannominata come "variante Kraken").

Variante BQ.1 e BQ.1.1 o Cerberus

Nel report del 21 ottobre 2022, il Centro europeo per la prevenzione e il controllo delle malattie (ECDC, dall'inglese European Centre for Disease Prevention and Control) ha segnalato che BQ.1 e BQ.1.1 sarebbero potute diventare le nuove varianti predominanti in Europa fra novembre e dicembre 2022.

Con l'ultimo report rilasciato il 13 gennaio 2023 dall'ECDC, è stato confermato un aumento della circolazione di BQ.1 sul suolo europeo che è diventata la sottovariante di Omicron predominante in circolazione (si precisa che si tratta di una stima media fatta sull'intero territorio dell'Europa).

BQ.1 deriva dalla variante di preoccupazione (VOC) Omicron 5 (BA.5), quella attualmente predominante.

Nel linguaggio comune, BQ.1 e BQ.1.1 sono stata rinominate come "variante Cerberus".

La principale preoccupazione deriva dal fatto che da studi preliminari è emerso che sia BQ.1 che BQ.1.1 hanno una maggior capacità di eludere le difese immunitarie rispetto a BA.5. Oltre a ciò, da tali studi è emerso che questi sotto-lignaggi di Omicron 5 sono in grado di resistere maggiormente rispetto a BA.5 al trattamento con alcuni anticorpi monoclonali attualmente impiegati contro la COVID-19.

Di contro, non si hanno prove sul fatto che BQ.1 e BQ.1.1 possano causare un'infezione e una malattia più severe rispetto a BA.5.

Per approfondire: Variante Cerberus BQ.1 e BQ.1.1: cosa sappiamo?

Variante XBB - variante Gryphon

XBB è una delle sottovarianti di Omicron sottoposta a monitoraggio da parte dell'Organizzazione Mondiale della Sanità. Più precisamente, si tratta di una variante ricombinante di BA.2.10.1 e BA.2.75 (conosciuta anche come variante Centaurus) che presenta mutazioni aggiuntive nella proteina Spike.

Tale sottovariante è stata segnalata in 35 Paesi, fra cui l'Italia (in particolare, i primi due casi sono stati segnalati in Abruzzo e in Friuli Venezia Giulia).

Prove preliminari di laboratorio suggeriscono che questa sottovariante sia quella con la maggior capacità di eludere la risposta immunitaria fino ad ora identificata. Per quel che riguarda l'eventuale capacità di causare un'infezione e una malattia più severe, invece, non ci sono ancora prove a riguardo.

La sottovariante XBB è stata rinominata come "variante Gryphon".

A dicembre 2022, l'ECDC ha inserito la variante Gryphon fra le varianti di interesse (VOI) nella sua classificazione.

Variante XBB.1.5 - variante Kraken

La variante Omicron XBB.1.5 è un sottolignaggio di XBB, soprannominata come "variante Kraken". L?OMS fa sapere che fra ottobre 2022 e gennaio 2023, questa variante è stata segnalata in 38 Paesi e che la maggior parte delle segnalazioni deriva dagli Stati Uniti.

La variante è presente anche in Europa; difatti, a partire dal 12 gennaio 2023, l'ECDC (il Centro europeo per il controllo e la prevenzione delle malattie) l'ha inserita nella lista delle varianti di interesse (VOI) secondo la sua classificazione (che, ricordiamo, si differenzia da quella dell'Organizzazione Mondiale della Sanità).

Da studi preliminari sembra emergere una maggior capacità di fuga immunitaria e una maggiore trasmissibilità di XBB.1.5 rispetto a XBB, ma non ci sono dati in merito alla possibilità che il nuovo sottolignaggio in questione possa causare una malattia più grave.

Varianti di Interesse - VOI

Le varianti di interesse o VOI (dall'inglese Variants of Interest) sono varianti che ancora non preoccupano tanto quanto le VOC sopra descritte, ma che vengono monitorate in quanto presentano mutazioni genetiche che sono note per avere, o per le quali si prevede, la capacità di influenzare le caratteristiche del virus, come ad esempio trasmissibilità, gravità della malattia indotta, "fuga immunitaria" (cioè capacità di "eludere" le difese immunitarie), resistenza al trattamento, ecc.

Secondo quanto riportato dall'ultimo agiornamento dell'Organizzazione Mondiale della Sanità, al momento non vi sono varianti di interesse circolanti.

Fra le varianti di interesse precedentemente circolanti, ne ricordiamo alcune:

  • Variante Epsilon;
  • Variante Zeta;
  • Variante Eta;
  • Variante Theta;
  • Variante Iota;
  • Variante Kappa;
  • Variante Lambda;
  • Variante Mu.

Varianti sotto Monitoraggio - VUM

Le varianti sottoposte a monitoraggio o a controllo (VUM - dall'inglese Variants Under Monitoring) sono varianti di SARS-CoV-2 individuate nel corso degli screening che vengono normalmente effettuati nel corso della pandemia, o sulla base di evidenze scientifiche preliminari.

Tali varianti vengono tenute sotto contorllo in quanto presentano mutazioni che si ritiene possano influenzare le caratteristiche del virus, rendendole simili ad alcune VOC, e comportando rischi e consguenze. Tuttavia, le prove a riguardo sono ancora deboli e l'evidenza dell'impatto fenotipico o epidemiologico ancora non è chiara e risulta quindi necessatio un loro monitoraggio e una valutazione successiva mentre si attende emergano nuove prove.

Secondo l'OMS, al momento non ci sono varianti sotto monitoraggio.

Tuttavia, fra le varianti tenute precedentemente sotto monitoraggio ne ricordiamo alcune:

  • Variante B.1.640 (segnalata per la prima volta in diversi Paesi a settembre 2021, ha ricevuto la designazione di VUM nel novembre del medesimo anno).
  • Variante XD (variante ricombinante segnalata per la prima volta in Francia a gennaio 2022; ha ottenuto la designazione di VUM a inizio marzo 2022).
Per saperne di più sulle Varianti Ricombinanti, leggi anche: Deltacron: Sintomi, Contagio e Cosa Sapere sulla Variante COVID-19

Sintomi delle Varianti

Come si presentano le malattie causate dalle Varianti del Nuovo Coronavirus?

Al momento, pare che i sintomi delle malattie indotte dalle varianti di SARS-CoV-2 alfa, beta, delta e gamma si manifestino con i medesimi sintomi con cui si manifesta la malattia causata dalle varianti precedenti.

Per approfondire: Coronavirus 2019-nCoV: Come Riconoscere i Primi Sintomi e Cosa Fare

L'eccezione sembra riguardare invece la variante Omicron e le sue sottovarianti (Omicron 2, Omicron 3, Omicron 4, Omicron 5), i cui sintomi paiono essere più lievi e con una durata di pochi giorni. Nonostante ciò, è opportuno precisare che per quanto riguarda gli individui suscettibili, la gravità dell'infezione sostenuta dalla variante Omicron di SARS-CoV-2 non è cambiata.

Per approfondire: Sintomi Omicron: Come Si Riconosce, Incubazione e Differenze

Farmaci e Vaccini

I Farmaci e i Vaccini disponibili sono Efficaci contro le Varianti?

I vaccini sono e restano efficaci nel prevenire la COVID-19 in forma grave e le conseguenze, anche molto severe, che possono scaturire dalla contrazione della malattia, anche quando indotta dalle varianti, benché alcune di esse possano presentare mutazioni capaci di diminuirne, almeno in parte, l'efficacia.

Le aziende produttrici di vaccini, come abiamo detto, si sono mosse in modo tale da offrire nuovi vaccini che fossero specifici contro Omicron e contro le sue sottovarianti BA.4 e BA.5, oltre che contro il ceppo originario di SARS-COV-2.

Per quanto riguarda i farmaci finora adottati nel trattamento della COVID-19 indotta da SARS-CoV-2, vi sono alcuni dati che indicano una riduzione dell'efficacia di alcuni anticorpi monoclonali. Ad ogni modo, studi e osservazioni in merito sono in corso e la situazione è in evoluzione.

Per approfondire: Farmaci COVID-19: quali sono? Come si Cura la COVID? Omicron 5 e altre Sottovarianti Omicron: come si curano, farmaci, quando preoccuparsi

Individuazione delle Varianti

Le Varianti possono essere Diagnosticate tramite i Test attualmente impiegati?

Stando alle informazioni finora disponibili, sembra che i test diagnostici attualmente in uso funzionino correttamente anche nella rilevazione delle varianti. Come si legge sul sito ufficiale dell'Istituto Superiore di Sanità "il Ministero della Salute raccomanda l'uso di test molecolari non esclusivamente basati sul gene S. Si può ricorrere ai test antigenici, ma per le eventuali conferme sono necessari  i test antigenici non rapidi (di laboratorio) o quelli rapidi con lettura in fluorescenza (cioè letti con apposite apparecchiature), che garantiscano alta specificità e sensibilità".

Per approfondire:

Tampone Molecolare COVID-19: Test Molecolare Test Antigenico COVID-19 - Test Antigenici Rapidi Tampone Rapido - Test Rapido COVID: Cos’è e Come Funziona?

Naturalmente, i test diagnostici non sono in grado di determinare quale variante ha colpito il paziente. Per conoscerla è necessario eseguire un test specifico noto come "sequenziamento", grazie al quale è possibile determinare l'esatto genoma del virus. Questo tipo di test, altamente specialistico, viene effettuato solo in appositi centri specializzati.

Monitoraggio delle Varianti

Come vengono Monitorate le Varianti del nuovo Coronavirus in Italia?

Nel nostro Paese le varianti vengono monitorate secondo le raccomandazioni dell'ECDC (dall'inglese European Centre for Disease Prevention and Control - Centro Europeo per il Controllo e la Prevenzione delle Malattie) e sotto la coordinazione dell'Istituto Superiore di Sanità.

In particolare l'ECDC raccomanda di selezionare casualmente a livello nazionale - quindi, di sequenziare - almeno circa 500 campioni ogni settimana con le seguenti priorità:

  • Individui vaccinati contro SARS-CoV-2 che successivamente si infettano nonostante una risposta immunitaria al vaccino;
  • Contesti ad alto rischio, quali ospedali nei quali vengono ricoverati pazienti immunocompromessi positivi a SARS-CoV-2 per lunghi periodi;
  • Casi di reinfezione;
  • Individui in arrivo da Paesi con alta incidenza di varianti SARS-CoV-2;
  • Aumento dei casi o cambiamento nella trasmissibilità e/o virulenza in un'area;
  • Cambiamento nelle performance di strumenti diagnostici o terapie;
  • Analisi di cluster, per valutare la catena di trasmissione e/o l'efficacia di strategie di contenimento dell'infezione.

Le analisi delle varianti vengono effettuate nei laboratori delle singole Regioni o Province Autonome ai quali l'ISS ha chiesto di "selezionare dei sottocampioni di casi positivi e di sequenziare il genoma del virus per individuare in particolare la presenza della variante inglese. Successivamente verrà poi individuata la presenza della variante brasiliana e, se necessario, anche quella sudafricana".

Come Proteggersi dalle Varianti?

Come riportato dall'Istituto Superiore di Sanità (ISS), al momento le misure per prevenire l'infezione rimangono invariate da quelle finora in uso. Pertanto, utilizzo delle mascherine, distanziamento sociale e igiene delle mani devono continuare ad essere rigorosamente adottate e rispettate in qualsiasi circostanza.

Naturalmente, è fondamentale rispettare anche tutte le indicazioni e le restrizioni imposte dalle normative attualmente in vigore.

Per approfondire: Reinfezione da SARS-CoV-2 e COVID-19: chi è guarito può ammalarsi di nuovo?

Ulteriori approfondimenti

Autore

Ilaria Randi
Laureata in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche, ha sostenuto e superato l’Esame di Stato per l’Abilitazione alla Professione di Farmacista